2013年新年伊始，方舟子就指责韩寒文章代笔，闹得满城风雨，如今年末了，他又说林志颖旗下产品“爱碧丽”为虚假保健品，并和崔永元就转基因技术吵嘴，这样一来，老百姓可从未敢忘了这位打假斗士，汪峰可真要跟方舟子学两招。

12月20日，一则崔永元指责方舟子的视频在网上引起了广泛关注。视频中，崔永元暗指方舟子多次向央视告状，而有媒体猜测这就是他从央视离开的原因。就此，记者联系了方舟子，他表示：“这完全是他(崔永元)在造谣。”

“假装在网上和你辩论，私下向你单位偷偷告状，告状的频率是每周一告或每天一告，单位与你核实用一天或一周，如此这般，周而复始，恶心。”昨天，崔永元在网上一段视频中的话迅速引来大家的关注。崔永元和方舟子关于转基因食品问题的骂战已经持续了几个月，两个人从对转基因技术问题的驳斥发展到攻击对方本人。而这一段话中所说的“告状”让有些媒体猜测，方舟子的不断“骚扰”是崔永元离开央视的真正原因。

在这段视频中，崔永元还说道：“在推广转基因技术这方面，我觉得其实我们看到了另一个方舟子，这个方舟子有点利欲熏心，这个时候他开始不讲逻辑、不讲方式，甚至不讲科学的方法，也不讲科学的规律，就是一个懂一点科学的市民混混，甚至我说难听一点，就是一个文痞甚至流氓，就是这样一个角色。”

记者联系到了方舟子，对于视频，他告诉记者，“我从来没有向央视指控过任何人，更何况是他(崔永元)。他完全是在造谣，我觉得是非常可笑的。我每次都是光明正大去驳斥别人，都是发到网上、微博上公开的，从来没有过私下指控。”而对此方舟子也在微博中写道：“我哪次投诉、起诉不是光明正大、公开的？” 关于转基因的问题，方舟子认为崔永元本身是带着一种有倾向的观点去美国调查的，而他所带去的翻译是一个极度反对转基因食品的人，“他曾经发表过很多反对转基因的观点。”而自称是学生物出身的方舟子称，崔永元“不是有一点不懂，是完全不懂(转基因技术)”。

方舟子认为，崔永元从来“不敢”对他的反驳做直接回应，“在微博上他的每一条关于转基因的内容，我都是直接在微博上反驳他，但是他从来都没有回应过我，每次都是转移到一个新的话题上，然后我再反驳他。”方舟子表示，这几个月他一直坚持关注崔永元发表的有关转基因的话题，进行驳斥，而后面如果崔永元继续发表观点，对于他不认可的，他还要继续反驳到底。          据《北京晨报》

崔永元：方舟子是离职的催化剂

半年以来，崔永元从央视离职的消息不断，而就在12月17日，崔永元正式宣布离开央视，入职中国传媒大学任教。20日，刚刚从美国回到北京的崔永元首度接受记者采访，详谈离职原因。

崔永元告诉记者，2002年他开始做口述历史的项目，耗费的精力特别大。在三年前，他就曾向台里提出过想要调到中国传媒大学工作。当时台里并不同意，也极度挽留他。今年，台里终于同意了。当然，由于今年陷入和方舟子的论战，方舟子的出现相当于催化剂，加速了他从央视离开。

提及在中国传媒大学开始的教师新生活。崔永元表示，传媒大学提供了8600平方米的大楼做口述历史博物馆，这个博物馆白天向公众开放，晚上则是学生自习教室。在传媒大学上的第一堂课，来了3000多名学生。他讲的口述历史概论，包括甲午海战等等。不过，做老师和做主持人相比，他还有些不习惯，比如中间铃声响的时候就特别不习惯。第一堂课，他就休息了一次。   据《成都商报》