第一层核心是“基地硬骨头”，这个核心是由拉登本人以及那些自八十年代以来一直随拉登鞍前马后跑的人组成，人数在数十人左右。也有一些有经验的人被吸纳入这层核心，比如说曾在菲律宾和其它地方屡屡制造炸弹爆炸事件的哈立德·穆罕默德。

第二层核心是数十个分散在世界各地的“基地”组织分支的领袖人物。这些组织分支往往原本就是当地极端组织，它们通过各种关系与拉登搭上线，并且得到拉登的完全赏识、信任和训练之后，才能进入“基地”圈子。

第三层核心是拉登最铁杆的秘密信徒。这些人并不从事恐怖行动，而是分散在世界各地，有着正当的职业和道德操守，但他们却秘密为拉登搜集情报和筹集资金！这个核心拉登非常看重。